Comme beaucoup d'orgues, celui-ci possède un second buffet plus petit, disposé en avant de la console sur le plancher de la tribune. Il renfermait à l'origine le "positif " mais est aujourd'hui muet car A. Cavaillé-Coll ne l'a pas réutilisé.

La soubasse de la pédale est le seul jeu qui nous reste de l'instrument d'origine du XVIIe. C'était à l'origine un jeu de flûte de 8' qu'Aristide Cavaillé-Coll a transformé en soubasse de 16' par obturation des tuyaux à la partie supérieure.

L'orgue a été relevé en 1932 par Maurice Puget. Les porte-vent originaux furent remplacés par de gros conduits en zinc. La soufflerie a été mécanisée en 1949 grâce à la générosité de Monseigneur Ambroise, alors curé de la cathédrale.

La partie instrumentale a été classée le 24 septembre 1971.

En 1982 les établissements Danion-Gonzalez effectuèrent un simple relevage à l'identique. Cependant il ne fut pas remédié au vieillissement du matériel devenu inefficace après un siècle d'utilisation.
A cette occasion le buffet fut également restauré et retrouva ses couleurs d'origine.

La rénovation complète de l'instrument a été depuis entreprise par la Manufacture Languedocienne de Grandes Orgues, les travaux étant échelonnés sur dix ans. Tous les ressorts en laiton ont été remplacés par de l'acier inox, les anti-secousses rétablis en peau et les écrous de cuir remis à neuf.

Dans la tranche de travaux réalisée en 1999, les porte-vent ont été rétablis comme à l'origine en bois. La console fut dotée d'un pédalier neuf plus étendu (trente notes), impliquant une mécanique totalement repensée.

Enfin en 2002 la soufflerie électrique a été remplacée par un modèle plus puissant et mieux adapté aux exigences de l'instrument.

L'harmonisation de l'orgue a été sans cesse retravaillée, afin de parvenir au magnifique instrument que nous pouvons entendre aujourd'hui.
Ce travail remarquable est à mettre à l'actif du facteur Charles Sarelot, successeur de Danion-Gonzalez, et de son équipe.